MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101

Total Repeats: 1673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016904	A	6	6	134	139	100 %	0 %	0 %	0 %	378715378
2	NC_016904	GC	3	6	157	162	0 %	0 %	50 %	50 %	378715378
3	NC_016904	ATT	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715378
4	NC_016904	TTCC	2	8	350	357	0 %	50 %	0 %	50 %	378715378
5	NC_016904	TGC	2	6	374	379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715378
6	NC_016904	GAAC	2	8	503	510	50 %	0 %	25 %	25 %	378715379
7	NC_016904	GCATG	2	10	519	528	20 %	20 %	40 %	20 %	378715379
8	NC_016904	TGC	2	6	533	538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715379
9	NC_016904	CGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715379
10	NC_016904	CA	3	6	674	679	50 %	0 %	0 %	50 %	378715379
11	NC_016904	CTGG	2	8	692	699	0 %	25 %	50 %	25 %	378715379
12	NC_016904	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715379
13	NC_016904	ACC	2	6	864	869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715380
14	NC_016904	CAG	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715380
15	NC_016904	A	6	6	1044	1049	100 %	0 %	0 %	0 %	378715380
16	NC_016904	GAA	2	6	1158	1163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715380
17	NC_016904	A	6	6	1162	1167	100 %	0 %	0 %	0 %	378715380
18	NC_016904	CAA	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715380
19	NC_016904	C	6	6	1264	1269	0 %	0 %	0 %	100 %	378715380
20	NC_016904	AT	3	6	1307	1312	50 %	50 %	0 %	0 %	378715380
21	NC_016904	CCGC	2	8	1343	1350	0 %	0 %	25 %	75 %	378715380
22	NC_016904	CTG	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
23	NC_016904	TCA	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715380
24	NC_016904	CAG	2	6	1488	1493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715380
25	NC_016904	TGA	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715380
26	NC_016904	GGT	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715380
27	NC_016904	GGCT	2	8	1683	1690	0 %	25 %	50 %	25 %	378715380
28	NC_016904	AAG	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715380
29	NC_016904	CCG	2	6	1722	1727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715380
30	NC_016904	GTC	2	6	1728	1733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
31	NC_016904	CGGG	2	8	1751	1758	0 %	0 %	75 %	25 %	378715380
32	NC_016904	GTGA	2	8	1809	1816	25 %	25 %	50 %	0 %	378715380
33	NC_016904	CAG	2	6	1919	1924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715380
34	NC_016904	A	6	6	2005	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	378715380
35	NC_016904	TAAA	2	8	2107	2114	75 %	25 %	0 %	0 %	378715380
36	NC_016904	GCT	2	6	2152	2157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
37	NC_016904	AAT	2	6	2187	2192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715380
38	NC_016904	GGT	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715380
39	NC_016904	CG	3	6	2271	2276	0 %	0 %	50 %	50 %	378715380
40	NC_016904	TGC	2	6	2392	2397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
41	NC_016904	GTGA	2	8	2423	2430	25 %	25 %	50 %	0 %	378715380
42	NC_016904	T	6	6	3011	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	378715381
43	NC_016904	GC	3	6	3086	3091	0 %	0 %	50 %	50 %	378715381
44	NC_016904	CCA	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715381
45	NC_016904	GAT	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715381
46	NC_016904	CTG	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
47	NC_016904	CAC	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715381
48	NC_016904	CTG	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
49	NC_016904	TTG	2	6	3283	3288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715381
50	NC_016904	GC	3	6	3296	3301	0 %	0 %	50 %	50 %	378715381
51	NC_016904	GTC	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
52	NC_016904	CAG	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715381
53	NC_016904	CTG	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
54	NC_016904	CGT	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
55	NC_016904	GAT	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715381
56	NC_016904	AGC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715381
57	NC_016904	CGC	2	6	3724	3729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715381
58	NC_016904	TC	3	6	3889	3894	0 %	50 %	0 %	50 %	378715381
59	NC_016904	GA	3	6	3900	3905	50 %	0 %	50 %	0 %	378715381
60	NC_016904	CCA	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715382
61	NC_016904	CAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715382
62	NC_016904	ACC	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715382
63	NC_016904	GCA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715382
64	NC_016904	AAG	2	6	4310	4315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715382
65	NC_016904	CAC	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715383
66	NC_016904	CCGG	2	8	5156	5163	0 %	0 %	50 %	50 %	378715383
67	NC_016904	CAC	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715384
68	NC_016904	CGGC	2	8	5320	5327	0 %	0 %	50 %	50 %	378715384
69	NC_016904	TCT	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715384
70	NC_016904	CGTC	2	8	5472	5479	0 %	25 %	25 %	50 %	378715384
71	NC_016904	CAG	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715384
72	NC_016904	CCGTAG	2	12	5553	5564	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378715384
73	NC_016904	TTC	2	6	5634	5639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715384
74	NC_016904	CGGC	2	8	5742	5749	0 %	0 %	50 %	50 %	378715384
75	NC_016904	CG	3	6	5785	5790	0 %	0 %	50 %	50 %	378715384
76	NC_016904	CGTG	2	8	5826	5833	0 %	25 %	50 %	25 %	378715384
77	NC_016904	CAC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715384
78	NC_016904	CTC	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715384
79	NC_016904	AGC	2	6	5892	5897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715384
80	NC_016904	GA	3	6	5990	5995	50 %	0 %	50 %	0 %	378715384
81	NC_016904	CGG	2	6	6127	6132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715384
82	NC_016904	CT	3	6	6159	6164	0 %	50 %	0 %	50 %	378715384
83	NC_016904	CGT	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715384
84	NC_016904	TGTCA	2	10	6176	6185	20 %	40 %	20 %	20 %	378715384
85	NC_016904	GA	3	6	6753	6758	50 %	0 %	50 %	0 %	378715385
86	NC_016904	A	6	6	6781	6786	100 %	0 %	0 %	0 %	378715385
87	NC_016904	AAT	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715385
88	NC_016904	TGC	2	6	6827	6832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715385
89	NC_016904	TGC	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715385
90	NC_016904	ATCC	2	8	6979	6986	25 %	25 %	0 %	50 %	378715385
91	NC_016904	GCTG	2	8	7055	7062	0 %	25 %	50 %	25 %	378715385
92	NC_016904	AT	3	6	7161	7166	50 %	50 %	0 %	0 %	378715386
93	NC_016904	TGA	2	6	7191	7196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715386
94	NC_016904	GAG	2	6	7204	7209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715386
95	NC_016904	GAA	2	6	7237	7242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715386
96	NC_016904	CTG	2	6	7266	7271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715386
97	NC_016904	TACA	2	8	7357	7364	50 %	25 %	0 %	25 %	378715386
98	NC_016904	AGG	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715386
99	NC_016904	GAA	2	6	7380	7385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715386
100	NC_016904	AGC	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715386
101	NC_016904	TAA	2	6	7563	7568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715386
102	NC_016904	CCG	2	6	7577	7582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715386
103	NC_016904	TGC	2	6	7685	7690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715386
104	NC_016904	TCCC	2	8	7694	7701	0 %	25 %	0 %	75 %	378715386
105	NC_016904	CAT	2	6	7725	7730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715386
106	NC_016904	ATG	2	6	7778	7783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715386
107	NC_016904	CAGCA	2	10	7799	7808	40 %	0 %	20 %	40 %	378715386
108	NC_016904	GCT	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715386
109	NC_016904	ATC	2	6	7918	7923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715386
110	NC_016904	AT	3	6	7937	7942	50 %	50 %	0 %	0 %	378715386
111	NC_016904	TGA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715386
112	NC_016904	CGG	2	6	8035	8040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715387
113	NC_016904	CTG	2	6	8091	8096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715387
114	NC_016904	TGC	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715387
115	NC_016904	GC	3	6	8176	8181	0 %	0 %	50 %	50 %	378715387
116	NC_016904	AGC	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715387
117	NC_016904	GCC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715387
118	NC_016904	AGGA	2	8	8294	8301	50 %	0 %	50 %	0 %	378715387
119	NC_016904	CAG	2	6	8313	8318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715387
120	NC_016904	CAGC	2	8	8357	8364	25 %	0 %	25 %	50 %	378715387
121	NC_016904	TGG	2	6	8374	8379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715387
122	NC_016904	TAA	2	6	8408	8413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715387
123	NC_016904	CAGG	2	8	8419	8426	25 %	0 %	50 %	25 %	378715387
124	NC_016904	GCC	2	6	8493	8498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715387
125	NC_016904	GGT	2	6	8955	8960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715388
126	NC_016904	TTG	2	6	8989	8994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715388
127	NC_016904	CTGA	2	8	9243	9250	25 %	25 %	25 %	25 %	378715388
128	NC_016904	AAG	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715388
129	NC_016904	TGA	2	6	9409	9414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715388
130	NC_016904	TGGGA	2	10	9461	9470	20 %	20 %	60 %	0 %	378715388
131	NC_016904	AGG	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715388
132	NC_016904	GAA	2	6	9531	9536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715388
133	NC_016904	ATCA	2	8	9537	9544	50 %	25 %	0 %	25 %	378715388
134	NC_016904	AACA	2	8	9558	9565	75 %	0 %	0 %	25 %	378715388
135	NC_016904	TGG	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715389
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137	NC_016904	AACAGC	2	12	9742	9753	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378715389
138	NC_016904	GTC	2	6	9792	9797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715389
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262	NC_016904	CTG	3	9	16879	16887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715401
263	NC_016904	CTG	2	6	16963	16968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715401
264	NC_016904	TCA	2	6	16994	16999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715401
265	NC_016904	CGG	2	6	17007	17012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715401
266	NC_016904	GCC	2	6	17019	17024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715401
267	NC_016904	CAGT	2	8	17085	17092	25 %	25 %	25 %	25 %	378715401
268	NC_016904	AGA	2	6	17232	17237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715401
269	NC_016904	GCG	2	6	17254	17259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715401
270	NC_016904	CGC	2	6	17299	17304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715401
271	NC_016904	CTG	2	6	17337	17342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715401
272	NC_016904	GAC	2	6	17353	17358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715401
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276	NC_016904	TG	3	6	17440	17445	0 %	50 %	50 %	0 %	378715401
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280	NC_016904	GTG	2	6	17522	17527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715401
281	NC_016904	GGT	2	6	17538	17543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715401
282	NC_016904	GCA	2	6	17567	17572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715401
283	NC_016904	TGA	2	6	17602	17607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715401
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285	NC_016904	ATG	2	6	18138	18143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715402
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287	NC_016904	ATG	2	6	18201	18206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715402
288	NC_016904	ACCGT	2	10	18253	18262	20 %	20 %	20 %	40 %	378715402
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291	NC_016904	TGTAC	2	10	18488	18497	20 %	40 %	20 %	20 %	378715403
292	NC_016904	ATC	2	6	18508	18513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715403
293	NC_016904	GTG	2	6	18562	18567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715403
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298	NC_016904	CGG	2	6	18746	18751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715403
299	NC_016904	GGCA	2	8	18777	18784	25 %	0 %	50 %	25 %	378715403
300	NC_016904	GAA	2	6	18850	18855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715403
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372	NC_016904	CAGA	2	8	22656	22663	50 %	0 %	25 %	25 %	378715407
373	NC_016904	GCC	2	6	22695	22700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715407
374	NC_016904	TGA	2	6	22701	22706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715407
375	NC_016904	TGA	2	6	22756	22761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715408
376	NC_016904	ACTGA	2	10	22764	22773	40 %	20 %	20 %	20 %	378715408
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378	NC_016904	TCAC	2	8	22852	22859	25 %	25 %	0 %	50 %	378715408
379	NC_016904	GAT	2	6	22895	22900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715408
380	NC_016904	TC	3	6	23005	23010	0 %	50 %	0 %	50 %	378715408
381	NC_016904	TGG	2	6	23039	23044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715408
382	NC_016904	CGT	2	6	23057	23062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715408
383	NC_016904	CAT	2	6	23153	23158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715408
384	NC_016904	AGG	2	6	23177	23182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715408
385	NC_016904	GCC	2	6	23237	23242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715409
386	NC_016904	GGCTGT	2	12	23248	23259	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378715409
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388	NC_016904	GTC	3	9	23271	23279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715409
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